In 1792 is er spake van een zogenaamde huissynagoge teVlagtwedde. Deze bevond zich in een kamer in het huis van Gompel Jacobs. Dit huis was in 1787 door hem aangekocht. Hoelang deze huissynagoge in gebruik is geweest, is onbekend.
In het begin van de 19e eeuw is er in elk geval geen sprake meer van. In 1866 vragen en krijgen de Vlagtwedder joden weliswaar een subsidie voor de bouw synagoge, maar dit leidt niet tot een daadwerkelijke bouw. In 1893 tracht men het zogenaamde passantenhuis te verwerven om hierin een synagoge te vestigen.
Kennelijk is dat gelukt, want na in 1896 verkrijgt men een subsidie voor het herstel van de synagoge en school. Later zouden de leden van de Joodse Gemeente Vlagtwedde een huissynagoge hebben gehad in het huis van mevrouw Braaf-Sachs aan de Kromme Elleboog. Vanaf 1921 bezocht men weer de synagoge te Bourtange.